Archiwum
Ośrodek Dokumentacji i Studium Pontyfikatu Jana Pawła II troszczy się o zbiór dokumentów archiwalnych. Zadaniem Ośrodka jest zabezpieczenie zbiorów archiwalnych, metodyczne ich opracowanie i katalogowanie. W tym celu sporządzono sześć działów:
- Pierwszym działem jest zbiór dokumentów dotyczących działalności i nauczania najpierw bpa, abpa, kard. Karola Wojtyły, i następnie Jana Pawła II. Wśród nich wyróżnić można grupę dokumentów związanych z okresem krakowskim (1958-1978), pochodzącą z Archiwum Kurii Metropolitalnej w Krakowie. Są to maszynopisy kazań, przemówień, artykułów, referatów, wykładów i memoriałów do władz PRL.
- Drugi dział stanowią dokumenty Jana Pawła II powstałe podczas jego pontyfikatu (1978-2005). Wgląd w archiwum pism papieskich wymaga zgody władzy kościelnej.
- Trzecim działem są dokumenty związane z działalnością i nauczaniem Ojca Świętego, które tworzą trzy zespoły archiwalne: Polskiej Sekcji Sekretariatu Stanu, ks. kard. Stanisława Dziwisza (osobistego sekretarza Ojca Świętego) i siostry dr Emilii Erlich OSU.
- Czwarty dział archiwalny pontyfikatu stanowi zbiór audiowizualny. Są to rejestrowane wystąpienia Papieża, płyty i kasety komercyjne oraz bogaty zbiór fotograficzny.
- Piątym działem jest dokumentacja związana z nadanymi Ojcu Świętemu tytułami naukowymi, z honorowymi obywatelstwami miast, z instytucjami noszącymi jego imię, nazwami ulic i placów oraz z ufundowanymi pomnikami.
- Szósty dział stanowi wielki zbiór numizmatyczny
srebrnych monet oraz kolekcje filatelistyczne, które
upamiętniając wydarzenia pontyfikatu posiadają także
wartość archiwalnego świadectwa.